Basis des Chemieunterrichts am Georg-Cantor-Gymnasium ist der Fachlehrplanes des Landes Sachsen-Anhalt.
Entsprechend dem mathematisch-naturwissenschaftlichen Profil unserer Schule wird der Fachlehrplan um Vertiefungen oder Erweiterungen ergänzt. Ein besonderes Augenmerk liegt auf der Herausbildung von naturwissenschaftlichen Arbeitsmethoden. Organisatorisch werden diese Ziele durch eine zusätzliche Wochenstunde in Klasse 9 und 10 unterstützt, die im halben Klassenverband unterrichtet wird. Sie schafft die Möglichkeit eines umfassenderen Bearbeitens chemischer Sachverhalte, die intensivere sprachliche und mathematische Darstellung von Zusammenhängen und Lösungswegen sowie die Kommunikation über aktuelle Forschungsergebnisse.
Der wissenschaftliche Anspruch des Chemieunterrichts wird ebenso deutlich durch den hohen Anteil experimentellen Unterrichts an individuellen Arbeitsplätzen im schuleigenen Chemielabor. Die erworbenen Kompetenzen können die Schülerinnen und Schüler zum Beispiel beim jährlich stattfindenden naturwissenschaftlichen Praktikum in Klasse 10 unter Beweis stellen. Dieses wird in enger Zusammenarbeit mit der Hochschule Merseburg auf dem Gebiet der Elektrochemie durchgeführt.